据国家气象中心《2009年6月上旬农业气象旬报》显示，6月上旬，全国大部棉区棉花处于第三至第五真叶期，新疆等地棉花已经开始现蕾，大部棉区气温接近常年或偏高；华北北部降水量较常年同期偏多，华北西部、西北地区大部降水偏少。新疆农区大部光热充足，对棉花现蕾有利。西北地区东部、华北、黄淮大部以晴好或阵性降水天气为主，河北、山西和山东出现干热风天气。西北地区东部和华北西部降水偏少5成以上，部分地区旱情严重。3～6日，河南北部和东部、安徽北部、江苏北部、山东西南部、山西南部出现雷雨、大风、冰雹等强对流天气，对棉花生长有一定影响。

    预计6月中旬，北京、天津、河北等将有两次降水天气过程；江南南部、华南降水量较常年同期偏多6～8成或2倍以上，11～14日和18～20日广西、广东、福建等地将出现强降雨，局部地区将出现短时雷雨大风等强对流天气。四川盆地、华北平原、江南、华南等地的部分地区将出现2～4天日最高气温在35℃以上的高温天气。